Jest to polecenie fastaq-chunker, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fastaq_chunker – Dzieli sekwencje na kawałki o równej wielkości
OPIS
użycie: fastaq_chunker [opcje]
Dzieli plik zawierający wiele sekwencji na osobne pliki. Dzieli sekwencje na fragmenty o ustalonej wartości
rozmiar. Ma na celu umieszczenie fragmentów chunk_size w każdym pliku, ale pozwala na trochę więcej, więc fragment może być
aż do (rozmiar_porcji + tolerancja), aby zapobiec tworzeniu się małych kawałków z końców sekwencji
pozycyjny argumenty:
infile Nazwa pliku wejściowego, który ma zostać podzielony
out Przedrostek pliku wyjściowego. Jeśli --jeden plik używany, a następnie nazwa pojedynczego pliku wyjściowego
rozmiar_fragmentu
Rozmiar każdego kawałka
tolerancja
Dopuszczalna tolerancja wielkości kawałka
fakultatywny argumenty:
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
--jeden plik
Wyprowadź wszystkie sekwencje w jednym pliku
--skip_all_Ns
Nie wyprowadzaj żadnej sekwencji składającej się ze wszystkich N
Korzystaj z fastaq-chunker online, korzystając z usług onworks.net