To jest polecenie kmc_tools-kmers_subtract, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
kmc_tools-kmers_subtract - oblicza odejmowanie dwóch baz danych KMC
STRESZCZENIE
kmc_tools kmers_subtract <output
[parametry_wyjściowe]>
OPIS
Wyjściowa baza danych będzie zawierała tylko k-mery, które są obecne w pierwszym zestawie wejściowym ale
nieobecny w drugim. Wartość licznika jest równa wartości z pierwszego wejścia
ustawiony.
OPCJE
Dla każdego wejścia dostępne są dodatkowe parametry:
-ci
wyklucz k-mery występujące mniej niż czasy
-cx
wyklucz k-merów występujących więcej niż czasy
Dla danych wyjściowych dostępne są dodatkowe parametry:
-ci
wyklucz k-mery występujące mniej niż czasy
-cx
wyklucz k-merów występujących więcej niż czasy
-cs
maksymalna wartość licznika
PRZYKŁAD
kmc -k28 plik1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 plik2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200
Korzystaj z kmc_tools-kmers_subtract online, korzystając z usług onworks.net