Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie SASHIMI, której najnowszą wersję można pobrać jako TPP_Setup_6.3.3.exe. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie SASHIMI z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZDJĘCIA EKRANU:
SASHIMIA
OPIS:
W ramach projektu Sashimi działa Trans-Proteomic Pipeline (TPP), dojrzały zestaw narzędzi do proteomiki opartej na specyfice masowej (MS, MS/MS): walidacja statystyczna, oznaczanie ilościowe, wizualizacja i konwertery surowych danych MS na otwarty plik mzML/ formatach mzXML.
Korzyści
- Wyszukiwarki baz danych (kometa itp.)
- SpecraST (wyszukiwarka bibliotek widm)
- Wyszukiwanie w masie otwartej (Magnum itp.)
- Kojak (wyszukiwanie sieciujące)
- Analiza DDA
- DISCo (analiza DIA)
- reSpect (analiza widma chimerycznego)
- Oznaczanie ilościowe MS1 i MS2, znakowane i nieznakowane
- Generowanie bazy danych wabika
- PeptideProphet (walidacja poziomu PSM)
- iProphet (weryfikacja poziomu peptydów)
- PTMProphet (weryfikacja modyfikacji potranslacyjnych)
- Walidacja poziomu białka
- Generowanie biblioteki widma
- Narzędzia do wizualizacji danych
- Katalogowanie i przewidywanie czasu retencji
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Internetowy, wiersz poleceń
Język programowania
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/sashimi/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.