To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie SOAPdenovo2, której najnowszą wersję można pobrać jako SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie SOAPdenovo2 z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
SOAPdenovo2
OPIS:
Co dalej z SOAPdenovo2:
MEGAHIT jest formalnym następcą SOAPdenovo2
MEGAHIT: Ultraszybkie jednowęzłowe rozwiązanie do dużych i złożonych zestawów metagenomicznych za pomocą zwięzłego wykresu de Bruijna
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Najnowszy kod na GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo to nowatorska metoda składania z krótkim odczytem, która może zbudować wersję roboczą de novo dla genomów wielkości człowieka. Program jest specjalnie zaprojektowany do składania krótkich odczytów Illumina. Stwarza nowe możliwości budowania sekwencji referencyjnych i przeprowadzania dokładnych analiz niezbadanych genomów w opłacalny sposób. SOAPdenovo2 jest następcą SOAPdenovo. Zacytuj artykuł opublikowany w GigaScience (patrz strona internetowa poniżej), jeśli chcesz zacytować SOAPdenovo2.
Publiczność
Nauka/Badania, Deweloperzy
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
C++, C
Środowisko bazy danych
Plik płaski
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.