Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie misc genomics Tools, której najnowszą wersję można pobrać jako misc_genomics_tools_v0.2.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie misc genomics tools z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZDJĘCIA EKRANU:
różne narzędzia genomiczne
OPIS:
Jest to zbiór różnych programów opracowanych w ramach projektu genomiki, obejmującego szczep Pseudomonas NCIMB10586
Należą do nich
* identyfikowanie i korygowanie błędów w (np.) sekwencji genomu pacbio przy użyciu odczytów illumina
* adnotacja sekwencji/genomu prokariotycznego
* Analiza RNAseq - normalizacja i zestawienie wielu próbek jako grupy
* Wizualizacja RNAseq
Wszystkie skrypty są dostarczane na zasadzie „dołożenia wszelkich starań”, jednak ze względu na różne zmiany systemowe nie gwarantuję, że wszystkie pliki są wersjami używanymi w analizie.
Należy również pamiętać, że zostały one opracowane z myślą o korzyściach — to znaczy oczekiwano, że proces zostanie przeprowadzony w ostatecznej formie raz; niewiele uwagi poświęcono optymalizacji środowiska uruchomieniowego lub łączeniu skryptów razem, a czasami dostęp do zasobów zewnętrznych uzyskuje się ręcznie.
Korzyści
- Korekcja błędów sekwencji genomu
- Adnotacja sekwencji prokariotycznej
- Normalizacja RNAseq wielu próbek jako grupy
- Seria próbek RNAseq / wizualizacja przebiegu w czasie
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Perl
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.