Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie symuluj_pcr, której najnowszą wersję można pobrać jako symuluj_PCR-v1.2.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie symuluj_pcr z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
symuluj_pcr
Ad
OPIS
Ocena specyficzności startera i przewidywanie zarówno pożądanych, jak i nietypowych produktów amplifikacji jest niezbędnym krokiem w solidnym projektowaniu testu PCR. Skrypt ten przewiduje potencjalne amplikony reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w bazie danych o dużych sekwencjach, takiej jak NCBI nt, z pojedynczego pleksu lub dużego multipleksowanego zestawu starterów, umożliwiając zdegenerowanie zasad starterów i sond, z tolerancją niedopasowania celu i zakresem długości amplikonu do ustawienia przez użytkownik. Kod symulacji amplikonu PCR opatruje również amplikony informacjami o genach automatycznie pobieranymi z NCBI i opcjonalnie może przewidzieć, czy w przewidywanych amplikonach występują również dopasowania sond TaqMan/Luminex. Jest to skrypt Perla wiersza poleceń o otwartym kodzie źródłowym o nazwie symuluj_PCR.pl, który wywołuje programy BLAST (Altschul i in., 1990) makeblastdb, blastn i blastdbcmd oraz narzędzie NCBI efetch (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi).Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/simulatepcr/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
