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PROGRAMA:

NOME

wossoutput - Encontra programas por dados de saída EDAM

SINOPSE

sem saída -identificador corda [-explodir booleano] [-mostrar palavras-chave booleano]
-sensível booleano -subclasses booleano -obsoleto booleano -gravar booleano
-embaixada booleano -showembaixada corda -cólon booleano -gui booleano
[-arquivo de saída arquivo de saída] [-html alternancia] [-grupos booleano] [-alfabética booleano]

sem saída -Socorro

DESCRIÇÃO

sem saída é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Ontologia: EDAM, Documentação".

OPÇÕES

Entrada seção
-identificador corda

Adicional seção
-explodir booleano
Os grupos aos quais os aplicativos EMBOSS pertencem têm duas formas, explodidas e não
explodiu. Os nomes dos grupos explodidos são mais numerosos e muitas vezes vagamente redigidos do que
os não explodidos. Os nomes explodidos são formados a partir de definições do grupo
nomes que começam como NAME1: NAME2 e que são expandidos em muitas combinações
dos nomes como: 'NAME1', 'NAME2', 'NAME1 NAME2', NAME2 NAME1 '. Os nomes não expandidos
são simplesmente como: 'NAME1 NAME2'. Valor padrão: N

-mostrar palavras-chave booleano
Valor padrão: N

Avançado seção
-sensível booleano
Por padrão, as palavras-chave da consulta são comparadas aos nomes dos termos EDAM (e sinônimos)
só. Esta opção também compara as palavras-chave com as definições de termos EDAM e
portanto (normalmente) relata mais correspondências. Valor padrão: N

-subclasses booleano
Estenda as correspondências de consulta para incluir todos os termos que são especializações (EDAM
subclasses) do tipo combinado. Valor padrão: Y

-obsoleto booleano
O comportamento padrão é não usar ou retornar termos obsoletos. Esta opção, se configurada,
inclui todos os termos. Valor padrão: N

-gravar booleano
Se você usar esta opção, a documentação do programa EMBOSS será pesquisada. Se este
opção for definida como falsa, então apenas os programas EMBAIXADA serão pesquisados ​​(se o
a opção -embassy é verdadeira). Os programas EMBASSY não são estritamente parte do EMBOSS, mas usam
as mesmas bibliotecas de código e compartilham a mesma aparência, mas geralmente são desenvolvidas
por pessoas que desejam que os programas estejam fora do esquema de Licença Pública Geral GNU
Valor padrão: Y

-embaixada booleano
Se você usar esta opção, a documentação do programa EMBASSY será pesquisada. Se este
opção for definida como falsa, então apenas os programas EMBOSS serão pesquisados ​​(se o
-a opção em relevo é verdadeira). Os programas EMBASSY não fazem parte estritamente do EMBOSS, mas usam o
mesmas bibliotecas de código e compartilham a mesma aparência, mas geralmente são desenvolvidas por
pessoas que desejam que os programas estejam fora do esquema de Licença Pública Geral GNU
Valor padrão: Y

-showembaixada corda
Se você usar esta opção, a documentação do programa do pacote EMBASSY será
pesquisado. Os programas EMBASSY não fazem parte estritamente do EMBOSS, mas usam o mesmo código
bibliotecas e compartilham a mesma aparência, mas geralmente são desenvolvidas por pessoas que
deseja que os programas estejam fora do esquema de Licença Pública Geral GNU

-cólon booleano
Os grupos que os aplicativos EMBOSS pertencem a até dois níveis, por exemplo o
o grupo primário 'ALINHAMENTO' tem vários subgrupos, ou grupos de segundo nível, por exemplo:
CONSENSO, DIFERENÇAS, DOT PLOTS, GLOBAL, LOCAL, MÚLTIPLO. Para ajudar programas que analisam
a saída de wossname que requer os nomes desses subgrupos, dois pontos ':' será
colocado entre o primeiro e o segundo nível do nome do grupo se esta opção for verdadeira.
Nota: Isso não se aplica se os nomes dos grupos foram explodidos com o 'explodir'
opção. Valor padrão: N

-gui booleano
Esta opção tem como objetivo ajudar aqueles que estão projetando interfaces gráficas de usuário para
os aplicativos EMBOSS. Alguns programas EMBOSS são inadequados para execução em uma GUI,
estes incluem outros programas de menu e editores interativos. Esta opção permite que você
relatar apenas os programas que podem ser executados a partir de um valor padrão da GUI: N

saída seção
-arquivo de saída arquivo de saída
Valor padrão: stdout

Html seção
-html alternancia
Se você estiver enviando a saída para um arquivo, será formatado para ser exibido como uma tabela
em um documento WWW. Valor padrão: N

-grupos booleano
Se você usar esta opção, então apenas os nomes dos grupos serão enviados para o arquivo Padrão
valor: N

-alfabética booleano
Se você usar esta opção, obterá uma única lista de nomes de programas e
descrições em vez dos programas listados em seus grupos funcionais. Predefinição
valor: N

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