Este é o aplicativo Linux chamado Pipeline Builder para ferramentas NGS, cuja versão mais recente pode ser baixada como pipeline_builder_20150106-1044-build-baf32e1.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Pipeline Builder para ferramentas NGS com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
CAPTURAS DE TELA:
Construtor de pipeline para ferramentas NGS
DESCRIÇÃO:
O manuseio com arquivos de configuração de ferramenta NGS é um verdadeiro desafio para biólogos e biotecnologistas modernos. Para aumentar a produtividade, especificidade e aprimorar o processamento dos dados, esta ferramenta disponibiliza um conjunto de comandos já estruturados, levando o usuário a construir o pipeline correto para os dados que deseja analisar.
Pipeline Builder é uma ferramenta de script para gerenciar pipelines de análise NGS complexos. Ele ajuda o usuário a compor comandos de ferramenta NGS e compor seu próprio pipeline de análise. Ele permite uma análise reproduzível independente de dados, criando um ambiente protegido que separa os dados dos resultados por meio da exportação de variáveis. Ele vem como uma ferramenta de linha de comando com menus de assistente e tutoriais passo a passo.
O Pipeline Builder é escrito em Perl e é multiplataforma.
Recursos
- Construção de gasoduto NGS
- Chamada paralela de ferramenta NGS
- Armazenamento de dados sem sobreposição e redundância
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Perl
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/pipelinebuilder/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.