Este é o aplicativo Linux denominado SOAPdenovo2, cuja versão mais recente pode ser baixada como SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SOAPdenovo2 com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SOAPdenovo2
DESCRIÇÃO:
O que vem a seguir SOAPdenovo2:
MEGAHIT é o sucessor formal do SOAPdenovo2
MEGAHIT: uma solução ultrarrápida de nó único para montagem metagenômica grande e complexa via gráfico sucinto de Bruijn
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Código mais recente no GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo é um novo método de montagem de leitura curta que pode construir um novo esboço de montagem para genomas de tamanho humano. O programa é especialmente projetado para montar leituras curtas Illumina. Ele cria novas oportunidades para a construção de sequências de referência e realização de análises precisas de genomas inexplorados de uma forma econômica. SOAPdenovo2 é o sucessor de SOAPdenovo. Cite o artigo publicado no GigaScience (veja o site abaixo) se quiser citar SOAPdenovo2.
Público
Ciência / Pesquisa, Desenvolvedores
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
C ++, C
Ambiente de Banco de Dados
Arquivo plano
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.