Este é o aplicativo do Windows chamado misc genomics tools cuja versão mais recente pode ser baixada como misc_genomics_tools_v0.2.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado ferramentas genômicas diversas com o OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
CAPTURAS DE TELA:
diversas ferramentas de genômica
DESCRIÇÃO:
Esta é uma coleção de vários programas desenvolvidos no decorrer de um projeto de genômica, envolvendo a cepa de Pseudomonas NCIMB10586
Estes incluem
* identificando e corrigindo erros em uma sequência de genoma (por exemplo) pacbio usando leituras de iluminação
* sequência procariótica/anotação do genoma
* Análise RNAseq - normalização e agrupamento de várias amostras como um grupo
* Visualização RNAseq
Todos os scripts são fornecidos com base nos 'melhores esforços', no entanto, devido a várias alterações no sistema, não garanto que todos os arquivos sejam da versão usada na análise.
Além disso, esteja ciente de que eles foram muito desenvolvidos com a conveniência em mente - ou seja, esperava-se que o processo fosse executado em sua forma final uma vez; pouco cuidado foi dado para otimizar o tempo de execução ou encadear scripts e, às vezes, recursos externos são acessados manualmente.
Funcionalidades
- Correção de erro de sequência de genoma
- Anotação de sequência procariótica
- Normalização RNAseq de várias amostras como um grupo
- Série de amostra RNAseq/visualização de curso de tempo
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.