cmtk-mcwarp - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

mcwarp - Înregistrare nerigidă multicanal

REZUMAT

mcwarp [opțiuni] mcaffineOutput

DESCRIERE

Înregistrarea imaginii B-spline nerigidă multicanal folosind histogramă sau covarianță
bazate pe măsuri comune de entropie

OPŢIUNI

Caritate Setul de instrumente Opţiuni (aceste sunt comun by toate CMTK instrumente)
--Ajutor
Scrieți lista cu opțiunile de bază ale liniei de comandă la ieșirea standard.

--ajută-toți
Scrieți lista completă a opțiunilor de linie de comandă de bază și avansate la ieșirea standard.

--wiki
Scrieți lista de opțiuni de linie de comandă la ieșirea standard în marcajul MediaWiki.

--om
Scrieți sursa paginii de manual în marcajul „nroff” la ieșirea standard.

--versiune
Scrieți versiunea setului de instrumente în ieșirea standard.

--ecou
Scrieți linia de comandă curentă la ieșirea standard.

--nivel-verbos
Setați nivelul de verbozitate.

--verbos, -v
Creșteți nivelul de verbozitate cu 1 (învechit; acceptat pentru compatibilitate cu versiunea anterioară).

--fire
Setați numărul maxim de fire paralele (pentru fire POSIX și OpenMP).

Principal Opţiuni
--out-arhivă , -o
Calea arhivei de ieșire. [Mod implicit: NICI UNUL]

--downsample-de la , -d
Factorul inițial de subeșantionare [1]. [Mod implicit: 1]

--downsample-to , -D
Factorul final de subeșantionare [1]. [Mod implicit: 1]

--reducerea eșantionului-medie
Eșantionare redusă utilizând medierea ferestrei glisante [implicit: dezactivat] ) [Mod implicit: 0]

--neted
Sigma nucleului de netezire gaussian în multipli de dimensiunea pixelilor imaginii șablon
[implicit: dezactivat]) [Mod implicit: 0]

--grid-spacing
Distanța inițială a rețelei punctelor de control în mm. [Mod implicit: 40]

--grid-spacing-exact
Spațierea inițială exactă a grilei, chiar dacă nu se potrivește cu FOV imagine. [Mod implicit: dezactivat]

--rafinare-grilă
Numărul de perfecționări ale grilei punctelor de control. [Mod implicit: 0]

--delay-refine-grid
Întârzieți rafinarea grilei punctului de control până după rafinarea pixelilor.

--adaptativ-fix-factor de prag
Factor de prag de intensitate [0..1] pentru fixarea adaptivă a parametrilor. [implicit: 0 -- nu
fixare] [Mod implicit: 0]

--adaptive-fix-thresh-factor-entropie
Factor de prag de entropie [0..1] pentru fixarea adaptivă a parametrilor. [implicit: 0 -- nu
fixare] [Mod implicit: dezactivat]

--fix-warp-x
Remediați transformarea (nu deformați) în direcția x.

--fix-warp-y
Remediați transformarea (nu deformați) în direcția y.

--fix-warp-z
Remediați transformarea (nu deformați) în direcția z.

--jacobian-constrângere-greutate
Greutate pentru constrângerea de conservare a volumului jacobian [Mod implicit: 0]

--histograme, -H
Utilizați histograme multidimensionale pentru a calcula entropiile [implicit. [Acest is il
Mod implicit]

--covarianta, -C
Utilizați determinanții matricei de covarianță pentru a calcula entropiile.

--cub, -c
Utilizați interpolarea cubică [implicit: liniar]

--mi Utilizați valoarea standard pentru informații reciproce [implicit] [Acest is il Mod implicit]

--nmi
Utilizați valorile de informații reciproce normalizate

--corecția-intensitate, -I
Corectați intensitățile imaginii folosind transformarea locală jacobiană pentru a păstra totalul
semnal

--marimea-pasului-initial
Dimensiunea inițială a pasului de optimizare în pixeli. [Mod implicit: 1]

--dimensiunea-final-pas
Dimensiunea inițială a pasului de optimizare în pixeli. [Mod implicit: 0.125]

--delta-f-threshold
Prag opțional pentru a opri optimizarea (nivelul) în cazul schimbării relative a țintei
funcția scade sub această valoare. [Mod implicit: 0]

AUTORI

Torsten Rohlfing, cu contribuții de la Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff și Yaroslav Halchenko

Utilizați cmtk-mcwarp online folosind serviciile onworks.net