Aceasta este comanda geneparse-mpi care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
geneparse - interfață de încărcare a fișierelor de secvență
SINAPSE
geneparse [opțiuni...] [input] [input2 ...] #citește intrare și scrie în stdout
DESCRIERE
Citește un fișier de secvență și îl scrie undeva (în mod implicit la stdout).
Un anumit interval dintr-un fișier de intrare poate fi specificat prin fișier[start,stop]. Patratul
parantezele pot fi schimbate pentru oricare dintre {[()]}, (de exemplu, „genome.fa[3000,4000]” sau
„genom.fa{3000~4000}”). Fiți conștienți de faptul că toate acestea ar putea fi analizate de shell-ul dvs. De asemenea
orice caracter non-cuvânt poate fi folosit pentru a separa numerele.
OPŢIUNI
--repeatmask|-r
utilizați secvențe soft-repeatmasked (adică: înlocuiți bazele minuscule cu N).
--sus|--demasca|-U
majuscule toate bazele.
--lungime|-l
imprimați doar lungimea și ieșiți
--curat|-c
nu adăugați o linie nouă când ați terminat
--versiune|-V
tipărește versiunea programului
--ajutor|-h
imprimă un mesaj de ajutor
--ieșire|-o
trimite ieșire la un fișier (în caz contrar, folosește stdout). --ieșire implică --curat.
--liniștit|-q
tace toate avertismentele
--verbos|-v
imprimă o mulțime de detalii suplimentare
Utilizați geneparse-mpi online folosind serviciile onworks.net