Aceasta este comanda kmc_tools-counters_subtract care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
kmc_tools-counters_subtract - calculează scăderea contoarelor a două baze de date KMC
REZUMAT
kmc_tools contoare_scădere <output
[parametri_ieșire]>
DESCRIERE
Baza de date de ieșire va conține numai k-mers care sunt prezenți în primul set de intrare și
au contoare mai mari decât k-merii corespunzători în al doilea set. Pentru fiecare k-mer the
contorul este egal cu diferența dintre contorul din primul set și contorul din
al doilea set.
OPŢIUNI
Pentru fiecare intrare există parametri suplimentari:
-ci
excludeți k-merii care apar mai puțin de ori
-cx
excludeți k-merii care apar mai mult decât ori
Pentru ieșire există parametri suplimentari:
-ci
excludeți k-merii care apar mai puțin de ori
-cx
excludeți k-merii care apar mai mult decât ori
-cs
valoarea maximă a unui contor
EXEMPLU
kmc - k28 fisier1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 fisier2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
Utilizați kmc_tools-counters_subtract online folosind serviciile onworks.net