Aceasta este aplicația Linux numită ArtificialFastqGenerator a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită ArtificialFastqGenerator cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
ArtificialFastqGenerator
DESCRIERE:
ArtificialFastqGenerator preia genomul de referință (în format FASTA) ca intrare și scoate fișiere FASTQ artificiale în format Sanger. Poate accepta scorurile de calitate de bază Phred din fișierele FASTQ existente și le poate folosi pentru a simula erorile de secvențiere. Deoarece FASTQ-urile artificiale sunt derivate din genomul de referință, genomul de referință oferă un standard de aur pentru variantele de apelare (polimorfisme cu nucleotide unice (SNP) și inserții și deleții (indels)). Acest lucru permite evaluarea unei conducte de analiză Next Generation Sequencing (NGS) care aliniază citirile cu genomul de referință și apoi apelează variantele.Public
Industria sănătății, Știință/Cercetare, Utilizatori finali avansați
Limbaj de programare
Java
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.