Aceasta este aplicația Linux numită PRIMUS, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită PRIMUS pentru a rula gratuit în Linux online cu OnWorks.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
PRIMUS să ruleze online în Linux
DESCRIERE:
NOU: Descărcați versiunea nouă cu Pedigree Reconstruction la primus.gs.washington.eduAceastă versiune este depășită și incompletă. Vă rugăm să vizitați noul site web pentru versiunea completă a PRIMUS.
Prezentăm o metodă adaptată de la teoria grafurilor care identifică întotdeauna setul maxim de indivizi neînrudiți în orice set de date și permite utilizarea parametrilor de ponderare în selecția eșantionului fără legătură. PRIMUS citește în estimările IBD generate de utilizator și emite setul maxim posibil de indivizi neînrudiți, având în vedere un prag specificat de relație. De asemenea, pot fi utilizate informații suplimentare pentru selecția preferențială a persoanelor. De exemplu, atunci când într-o rețea există două seturi maxime egale de indivizi neînrudiți, PRIMUS poate selecta de preferință setul cu mai mulți indivizi afectați.
Abonați-vă la lista de e-mail PRIMUS-Users pentru notificări de actualizări și versiuni noi.
Software relevant:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
DESCRIERE
- Identifică setul maxim de indivizi neînrudiți dintr-un set de date genetice
- Grupează mostre în rețele de familie
- Generează fișiere .dot pentru a vizualiza rețelele de familie
Public
Industria sănătății, Știință/Cercetare, Educație
Limbaj de programare
Perl
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.