Aceasta este aplicația Linux numită RNAseqR, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca RNAseqR_1.1.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită RNAseqR pentru a rula gratuit în Linux online cu OnWorks.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
RNAseqR să ruleze online în Linux
DESCRIERE:
RNAseqR este conceput pentru analiza expresiei datelor ARN-seq și este cel mai potrivit pentru analiza bibliotecilor multiple, nereplicate. Este un program codificat C++, compilat în prezent pentru sistemele Linux.Cu interfețe GUI și linie de comandă, poate face transformări jurnal, PPM și/sau RPKM (dacă sunt furnizate lungimi), precum și analize statistice pentru expresia diferențială, folosind funcția de distribuție cumulativă binomială negativă (CDF) sau statistica testului R introdus pentru analiza EST de Stekel, et al.
Ieșirea permite decizii bazate pe probabilitățile CDF, valorile R de top sau compararea valorilor R cu date randomizate. Comparațiile sunt metrica de credibilitate a lui Stekel și colab. sau R observat față de așteptat la o expresie medie dată. Randomizarea se face prin Poisson sau distribuții binomiale negative sau amestecarea coloanelor.
Limbaj de programare
C ++
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.