Это команда cpgreporte, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
cpgreport - Идентифицируйте и сообщайте о богатых CpG областях в нуклеотидной последовательности (ах)
СИНТАКСИС
cpgreport -последовательность Seqall -Гол целое -выходной файл Outfile -победить подвиг
cpgreport -Помощь
ОПИСАНИЕ
cpgreport это программа командной строки от EMBOSS («European Molecular Biology Open
Программный пакет »). Он является частью командных групп «Nucleic: CpG Islands».
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
вход .
-последовательность Seqall
необходимые .
-Гол целое
Это устанавливает оценку для каждой найденной последовательности CG. Значение 17 более чувствительно, но
28 также использовался с некоторым успехом. Значение по умолчанию: 17
Результат .
-выходной файл Outfile
-победить подвиг
Файл для функций вывода
Используйте cpgreporte онлайн с помощью сервисов onworks.net