Это команда gt-encseq-encode, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
gt-encseq-encode - эффективное кодирование файлов последовательностей (FASTA / FASTQ, GenBank, EMBL).
СИНТАКСИС
gt Encseq шифровать файл_последовательности [файл_последовательности [файл_последовательности ...]]
ОПИСАНИЕ
-показать статистику [да | нет]
показать результаты сжатия (по умолчанию: нет)
-ссп [да | нет]
позиции разделителя выходной последовательности в файл (по умолчанию: да)
-дез [да | нет]
вывести описание последовательности в файл (по умолчанию: да)
-sds [да | нет]
позиции разделителя описания выходной последовательности в файл (по умолчанию: да)
-мд5 [да | нет]
выводить суммы MD5 в файл (по умолчанию: да)
-clipdesc [да | нет]
описания клипов после первого пробела (по умолчанию: нет)
-Суббота [string]
укажите вид представления последовательности одним из ключевых слов direct, bytecompress,
eqlen, bit, uchar, ushort, uint32 (по умолчанию: undefined)
-ДНК [да | нет]
ввод - последовательность ДНК (по умолчанию: нет)
-белок [да | нет]
ввод - последовательность белка (по умолчанию: нет)
-простой [да | нет]
обрабатывать как обычный текст (по умолчанию: нет)
-имя_индекса [string]
укажите имя для создаваемого индекса (по умолчанию: не определено)
-smap [string]
указать файл, содержащий отображение символов (по умолчанию: undefined)
-без потерь [да | нет]
разрешить получение исходной последовательности без потерь (по умолчанию: нет)
-v [да | нет]
быть подробным (по умолчанию: нет)
-Помощь
отобразить справку по основным параметрам и выйти
-help +
отобразить справку по всем параметрам и выйти
-версия
отобразить информацию о версии и выйти
СОСТАВЛЕНИЕ ОТЧЕТОВ ОШИБКИ
Сообщайте об ошибкахgt-users@genometools.org>.
Используйте gt-encseq-encode онлайн с помощью сервисов onworks.net