Это команда kmc_tools-counters_subtract, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
kmc_tools-counters_subtract - вычислить вычитание счетчиков двух баз данных KMC
СИНТАКСИС
kmc_tools counters_subtract <output
[output_params]>
ОПИСАНИЕ
Выходная база данных будет содержать только k-мер, которые присутствуют в первом входном наборе, и
иметь счетчики выше соответствующих k-мер во втором наборе. Для каждого к-мера
счетчик равен разнице между счетчиком в первом наборе и счетчиком в
второй набор.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
Для каждого входа есть дополнительные параметры:
-ci
исключить k-меры, встречающиеся меньше, чем раз
-cx
исключить k-мерки, встречающиеся более чем раз
Для вывода есть дополнительные параметры:
-ci
исключить k-меры, встречающиеся меньше, чем раз
-cx
исключить k-мерки, встречающиеся более чем раз
-cs
максимальное значение счетчика
ПРИМЕР
kmc - k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
Используйте kmc_tools-counters_subtract онлайн с помощью сервисов onworks.net