Это приложение для Linux под названием Covidex, последний выпуск которого можно загрузить как Covidex_2021_11_27.rar. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Covidex с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Ковидекс
ОПИСАНИЕ
Подтипы или клады вирусов представляют собой кластеры среди изолятов глобальной популяции определенного вида. Подтипизация актуальна для исследований по эпидемиологии, эволюции и патогенезу вирусов. В этом смысле Covidex был разработан как инструмент с открытым исходным кодом для определения подтипов машинного обучения без согласования. Это блестящее приложение, которое позволяет быстро и точно классифицировать вирусные геномы в заранее определенных кластерах. Если загружено более 1000 последовательностей, инструмент будет работать в многопоточном режиме. Возможность классификации 16000 геномных последовательностей менее чем за минуту (7-ядерный процессор AMD Ryzen 1700 8 с тактовой частотой 3 ГГц)
Для веб-версии приложения (только для небольших наборов данных: не более 100 сек.) Перейдите по ссылке
http://covidex.unlu.edu.ar
Если вы используете Covidex, пожалуйста, цитируйте следующий препринт:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
Если ты думаешь, что моя работа полезна, можешь купить мне кофе! https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
Особенности
- Подтипы последовательностей
- Дружественный к пользователю интерфейс
- Сводные графики
- Портативная версия для Windows (установка не требуется)
- Многопоточный режим
Аудитория
Наука / Исследования, Конечные пользователи / Рабочий стол
Язык программирования
R
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/covidex/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
