Это приложение для Linux под названием DACO-algorithm, последнюю версию которого можно загрузить как JDACO_1.03.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием DACO-алгоритм с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ:
DACO-алгоритм
ОПИСАНИЕ:
Экспрессия эукариотических генов контролируется с помощью молекулярных логических схем, которые объединяют регуляторные сигналы многих различных факторов. Комплексирование факторов транскрипции и других регуляторных белков является преобладающим и высококонсервативным механизмом интеграции сигналов в критических регуляторных путях и позволяет сделать вывод о контролируемых генах, а также о задействованном регуляторном механизме.
Мы разработали DACO (оптимизация связности с учетом домена), новый алгоритм, который сочетает в себе сети взаимодействия белок-белок и сети взаимодействия домен-домен с метрической связностью кластерного качества. Показатель локально максимизируется на целостном уровне белковых взаимодействий, в то время как сложные ограничения связности на уровне домена используются для учета исключительной и, следовательно, по своей сути комбинаторной природы взаимодействий внутри таких сборок.
Оригинальную публикацию можно найти на http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/17/i415 .
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал
Язык программирования
Питон, Ява
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/dacoalgorithm/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.