Это приложение для Linux под названием GMATA software for Genomic SSR marker, последний выпуск которого можно загрузить как GMATAv2.2.jar. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Программное обеспечение GMATA для маркера Genomic SSR бесплатно с помощью OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ:
Программное обеспечение GMATA для маркера Genomic SSR
ОПИСАНИЕ:
Что такое программа GMATA v21
Полногеномный микросателлитный анализ к применению (GMATA) - это программное обеспечение для анализа простых последовательностей (SSR), а также для конструирования и картирования маркеров SSR в любых последовательностях ДНК. Он выполняет следующие функции:
1. Добыча ССР;
2. Статистический анализ и построение графиков;
3. Графический просмотр локусов SSR;
4. Конструирование маркеров;
5. Электронное картографирование и исследование переносимости маркеров.
GMATA точен, чувствителен и быстр. Он был разработан для обработки больших наборов данных геномных последовательностей, особенно больших полногеномных последовательностей. Теоретически GMATA может легко проанализировать геномы любого размера. Программное обеспечение GMATA работает на сервере, настольном компьютере или даже ноутбуке, и оно может запускаться в графическом интерфейсе одним щелчком мыши, запускаться в командной строке или в автоматизированном конвейере. Он также кроссплатформенный и поддерживает Unix / Linux, Win и Mac. Результаты программного обеспечения GMATA могут напрямую отображаться графически с функциями генома или генов в Gbrowser и легко интегрироваться с любой геномной базой данных.
Особенности
- Точный и самый быстрый майнинг SSR в любых больших последовательностях
- Полный статистический анализ и построение графиков
- Графическое отображение SSR-локусов и маркеров в Gbrowser с особенностями генома
- Конструирование специфических SSR-маркеров и имитация ПЦР
- Электронное картографирование и исследование возможности передачи маркеров
- также доступно на https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/gmata/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.