Это приложение для Linux под названием MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, последний выпуск которого можно загрузить как meta_phat.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MetaPhat -meta-pheno-association-tracker с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ:
MetaPhat -мета-фено-ассоциация-трекер
ОПИСАНИЕ:
MetaPhat - это активный инструмент с открытым исходным кодом (лицензия MIT) для обнаружения вариантов с многомерными ассоциациями с использованием сводной статистики одномерных исследований GWAS. Приложение также выполняет декомпозицию, находя оптимальные подмножества BIC и характеристики драйвера P-значения для многомерных вариантов отведений. Варианты результатов отслеживаются и группируются, чтобы помочь в анализе взаимосвязи фенотип-генотип.Пожалуйста, посетите нашу вики-страницу для инструкций по установке, необходимых форматов данных GWAS и примеров ввода с помощью тестовой команды - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Глобальные липиды (GLGC, Willer 2013), пример данных / источника смолы - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Если у вас возникнут проблемы или у вас возникнут запросы на новые функции после того, как вы попробуете пример и прочитаете руководство, отправьте электронное письмо: jake.lin@helsinki.fi
Авторское право <2019> jake.lin@helsinki.fi, matti.pirinen@helsinki.fi
Особенности
- многомерный анализ геномных признаков
- Выбор оптимального подмножества признаков на основе p-значения и BIC
- графики следов разложения по признакам
- файл сводки SNP и характеристик водителя
- кластер копейщика snp-snp trait rank
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.