Это приложение для Linux под названием PRIMUS для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием PRIMUS, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
PRIMUS для работы в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ:
НОВИНКА: Загрузите новую версию с реконструкцией родословной на primus.gs.washington.eduЭто устаревшие и неполные версии. Посетите новый веб-сайт, чтобы получить полную версию ПРИМУС.
Мы представляем метод, адаптированный из теории графов, который всегда определяет максимальный набор несвязанных лиц в любом наборе данных и позволяет использовать параметры взвешивания при отборе несвязанных выборок. PRIMUS считывает сгенерированные пользователем оценки IBD и выводит максимально возможный набор не связанных между собой лиц с заданным порогом родства. Также может быть использована дополнительная информация для предпочтительного отбора лиц. Например, если в сети есть два максимальных набора не связанных между собой лиц одинакового размера, PRIMUS может предпочтительно выбрать набор с большим количеством затронутых лиц.
Подпишитесь на список рассылки PRIMUS-Users для получения уведомлений об обновлениях и новых версиях.
Соответствующее программное обеспечение:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Особенности
- Определяет максимальный набор неродственных особей из набора генетических данных
- Группирует образцы в семейные сети
- Создает файлы .dot для визуализации семейных сетей
Аудитория
Здравоохранение, Наука / Исследования, Образование
Язык программирования
Perl
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.