Это приложение для Linux под названием Seal, последний выпуск которого можно загрузить как seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Seal with OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Печать
ОПИСАНИЕ:
Seal - это распределенный набор инструментов для согласования и анализа короткого чтения на основе Hadoop. В настоящее время Seal включает инструменты для: демультиплексирования чтения, выравнивания чтения, удаления повторяющихся чтений, сортировки отображений чтения и расчета статистики для эмпирической калибровки базового качества. Уплотняйте весы, легко обрабатывая ТБ данных.Особенности
- выравнивание по короткому чтению (на основе BWA)
- идентификация повторного прочтения
- сортировка чтения сопоставлений
- рассчитать таблицы перекалибровки качества эмпирической базы
- быстрый, масштабируемый, надежный (работает на Hadoop)
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.