Это приложение для Windows под названием FastQC, последнюю версию которого можно загрузить как v0.12.1sourcecode.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием FastQC с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ:
Быстрый контроль качества
ОПИСАНИЕ:
FastQC — это инструмент анализа контроля качества, предназначенный для выявления потенциальных проблем в наборах данных высокопроизводительного секвенирования. Его цель — предоставить простой способ проверки качества необработанных данных секвенирования, поступающих из конвейеров секвенирования с высокой пропускной способностью. Это достигается путем запуска модульного набора анализов одного или нескольких необработанных файлов последовательностей в формате fastq или bam. Затем он создает отчет, в котором суммируются результаты и выделяются любые области, в которых библиотека может показаться необычной. Затем это должно направить вас туда, где ваши данные могут иметь проблемы, и позволить вам предпринять необходимые шаги для их исправления, прежде чем приступать к дальнейшему анализу.
FastQC не привязан к какому-либо конкретному методу секвенирования, поэтому его можно использовать для просмотра библиотек различных типов экспериментов (геномное секвенирование, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq и т. д. и т. д.).
Особенности
- Импорт данных из файлов BAM, SAM или FastQ
- Предлагает краткий обзор, который выделяет потенциальные проблемные области
- Сводные графики и таблицы для быстрой оценки данных
- Экспорт результатов в HTML
- Можно использовать в автономном режиме
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.