Это приложение для Windows под названием misc genomics tools, последний выпуск которого можно загрузить как misc_genomics_tools_v0.2.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Misc Genomics Tools вместе с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ:
разные инструменты геномики
ОПИСАНИЕ:
Это набор различных программ, разработанных в ходе проекта по геномике с участием штамма Pseudomonas NCIMB10586.
К ним относятся
* выявление и исправление ошибок в (например) последовательности генома пакбио с использованием чтения illumina
* прокариотическая последовательность/аннотация генома
* Анализ РНКсек - нормализация и сопоставление нескольких образцов в группу
* Визуализация РНКсек
Все сценарии предоставляются на основе «максимальных усилий», однако из-за различных системных изменений я не гарантирую, что все файлы являются той версией, которая использовалась при анализе.
Кроме того, имейте в виду, что они были разработаны с учетом целесообразности, то есть ожидалось, что процесс будет выполнен в его окончательной форме один раз; мало внимания уделялось оптимизации времени выполнения или объединению сценариев вместе, а иногда доступ к внешним ресурсам осуществляется вручную.
Особенности
- Исправление ошибок последовательности генома
- Аннотация последовательности прокариот
- Нормализация RNAseq нескольких образцов как группы
- Серия образцов RNAseq/визуализация во времени
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Perl
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.