gt-tallymer-search - ออนไลน์ใน Cloud

โครงการ:

ชื่อ

gt-tallymer-search - ค้นหาชุดของ k-mers ในดัชนีที่สร้างโดย ``gt tallymer
mkindex''

เรื่องย่อ

gt เครื่องนับ ค้นหา [ตัวเลือก] -tyr tallymer-index -q queryfile0 [queryfile1..] [ตัวเลือก]

DESCRIPTION

-ไทร์ [เชือก]
ระบุ tallymer-index (ค่าเริ่มต้น: undefined)

-q
ระบุชื่อไฟล์แบบสอบถาม

- สแตรนด์ [เชือก]
ระบุเกลียวที่จะค้นหา: ใช้ f (สำหรับเกลียวไปข้างหน้า) หรือ p (สำหรับย้อนกลับ
สาระเสริม) หรือ fp (สำหรับทั้งคู่); ค่าเริ่มต้นคือ f (ค่าเริ่มต้น: f)

-เอาต์พุต
ระบุแฟล็กเอาต์พุต (qseqnum, qpos, นับ, ลำดับ)

-v [ใช่|ไม่]
ละเอียด (ค่าเริ่มต้น: ไม่)

-ช่วยด้วย
แสดงความช่วยเหลือและออก

-version
แสดงข้อมูลเวอร์ชันและออก

รายงาน ข้อบกพร่อง

รายงานจุดบกพร่องไปที่kurtz@zbh.uni-hamburg.de>.

ใช้ gt-tallymer-search ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net