kmc_tools-complex - ออนไลน์ใน Cloud

โครงการ:

ชื่อ

kmc_tools-complex - การดำเนินการที่ซับซ้อนพร้อมฐานข้อมูลอินพุตจำนวนหนึ่ง

เรื่องย่อ

kmc_tools คอมเพล็กซ์

DESCRIPTION

คำสั่งนี้ดำเนินการชุดของการดำเนินการตามที่กำหนดโดย
. เป็นไฟล์ข้อความที่มีไวยากรณ์ต่อไปนี้:

__________________________________________________________________
|อินพุต: |
| = [params] |
| = [params] |
-
| = [params] |
|เอาต์พุต: |
| = [ [... ] |
|[OUTPUT_PARAMS: __|
| ] | /
- - -
|____________________________________________________|/

พารามิเตอร์

อินพุต1, อินพุต2, ... อินพุตN
ชื่อของอินพุตที่ใช้กำหนดสมการ

อินพุต 1_db_path อินพุต 2_db_path ... อินพุตN_db_path
เส้นทางสู่ชุด k-mers

สำหรับแต่ละอินพุตมีพารามิเตอร์เพิ่มเติมที่สามารถตั้งค่าได้:

-ci
ไม่รวม k-mers ที่เกิดขึ้นน้อยกว่า ครั้ง

cx
ไม่รวม k-mers ที่เกิดขึ้นมากกว่า ครั้ง

out_db_path
เส้นทางไปยังฐานข้อมูลเอาต์พุต

ref_input
หนึ่งในอินพุต1,อินพุต2, ...,อินพุตN

ดำเนินงาน
หนึ่งใน {*,-,~,+} ซึ่งหมายถึง {intersect, kmers_subtract, counters_subtract,
สหภาพ}

ตัวดำเนินการ '*' มีลำดับความสำคัญสูงสุด ตัวดำเนินการอื่นมีลำดับความสำคัญเท่าเทียมกัน คำสั่งของ
การดำเนินการสามารถเปลี่ยนแปลงได้ด้วยวงเล็บ

พารามิเตอร์ขาออก:

-ci
ไม่รวม k-mers ที่เกิดขึ้นน้อยกว่า ครั้ง

-cx
ไม่รวม k-mers ที่เกิดขึ้นมากกว่า ครั้ง

-cs
ค่าสูงสุดของตัวนับ

ตัวอย่าง

__________________________________________________________________
|อินพุต: |
|set1 = kmc_o1 -ci5 |
|set2 = kmc_o2 |
|set3 = kmc_o3 -ci10 -cx100 __|
|เอาต์พุต: | /
|ผลลัพธ์ = (set3+set1)*set2 | /
|____________________________________________________|/

ใช้ kmc_tools-complex ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net