masai_output_se - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

masai_output_se - เอาต์พุต Masai - โหมดสิ้นสุดเดียว

เรื่องย่อ

masai_output_se [ตัวเลือก]

DESCRIPTION

Masai เป็นเครื่องอ่านแผนที่ที่รวดเร็วและแม่นยำโดยอิงจากเมล็ดพืชโดยประมาณและหลายรายการ
ย้อนรอย

ดู http://www.seqan.de/projects/masai สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม

(c) ลิขสิทธิ์ 2011-2012 โดย Enrico Siragusa

-h, --ช่วยด้วย

แสดงข้อความช่วยเหลือนี้

--รุ่น

แสดงข้อมูลเกี่ยวกับรุ่น

ตัวเลือกการทำแผนที่:

-ง, --ไม่มีช่องว่าง

อย่าจัดแนวการอ่านที่มีช่องว่าง

-m, --ตรงกัน NUM

จำนวนการแข่งขันสูงสุดต่อการอ่าน

ตัวเลือกเอาต์พุต:

-t, --tmp-โฟลเดอร์ STR

ระบุโฟลเดอร์ชั่วคราวขนาดใหญ่ ค่าเริ่มต้น: ใช้โฟลเดอร์จีโนม

-o, --output-ไฟล์ ไฟล์

ระบุไฟล์เอาต์พุต ค่าเริ่มต้น: ใช้คำนำหน้าชื่อไฟล์ที่อ่าน ประเภทไฟล์ที่ถูกต้อง
คือ: ดิบและแซม

-nc, --ไม่มีซิการ์

ห้ามส่งออกสตริง CIGAR สิ่งนี้มีผลกับเอาต์พุต SAM เท่านั้น

ตัวเลือกการดีบัก:

-NS, --ไม่มีการถ่ายโอนข้อมูล

อย่าทิ้งผลลัพธ์

VERSION

เวอร์ชัน masai_output_se: 0.7.1 [14053] อัปเดตล่าสุด 2013-05-16

ใช้ masai_output_se ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net