นี่คือคำสั่ง rdp-alignment ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator หรือ MAC OS online emulator
โครงการ:
ชื่อ
rdp-alignment: - แพ็คเกจเครื่องมือการจัดตำแหน่ง Ribosomal Database Project (RDP)
เรื่องย่อ
rdp-การจัดตำแหน่ง
DESCRIPTION
แพ็คเกจเครื่องมือ Alignment มีคำสั่งให้ทำการวิเคราะห์ชุมชนที่กำหนดไว้ pairwise
การจัดตำแหน่งและรูปแบบมาร์คอฟที่ซ่อนอยู่ (รุ่น HMMER3 ไม่มีการฝึกอบรม)
OPTIONS
รายการของ คำสั่งย่อย:
การจัดตำแหน่งควบรวมกิจการ
- ผสานการจัดตำแหน่ง
pairwise-knn
- คำนวณ k เพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุดโดยการจัดตำแหน่งคู่
เปรียบเทียบข้อผิดพลาดประเภท
- ตรวจจับข้อผิดพลาดการแทรก การลบ และการแทนที่ตามลำดับเมื่อเทียบกับ
ลำดับอ้างอิง
จัดตำแหน่ง nucl-to-prot
- ถ่ายโอนการจัดตำแหน่งลำดับจากลำดับโปรตีนไปยังลำดับนิวคลีโอไทด์
RM-partialseq
- ลบลำดับบางส่วนตามการจัดตำแหน่งคู่ไปยังลำดับอ้างอิง
ใช้การจัดตำแหน่ง rdp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net