นี่คือแอป Linux ชื่อ EigenMS เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ EigenMS.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ EigenMS เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
EigenMS เพื่อรันบน Linux ออนไลน์
รายละเอียด:
EigenMS เป็นวิธีการทำให้เป็นมาตรฐานที่ใช้ใน R (และเวอร์ชันเก่าใน Matlab) ที่มีอยู่ในชุดของสองฟังก์ชันที่ควรใช้ตามลำดับโปรดดาวน์โหลดไฟล์ EigenMS.zip (เวอร์ชันล่าสุด)
เวอร์ชันล่าสุดที่อัปโหลดในเดือนตุลาคม 2017 มีการแก้ไขข้อบกพร่องสำหรับการทำให้กลุ่มการรักษาเดี่ยวเป็นมาตรฐาน
การปรับขนาดถูกละเว้นจากปี 2015
EigenMS ใช้ SVD เพื่อตรวจจับแนวโน้มอคติในข้อมูลและกำจัดมัน EigenMS ขจัดผลกระทบจากปัจจัยที่รู้จักและไม่รู้จัก และสามารถใช้กับแพลตฟอร์ม -omic ใดก็ได้
เราได้แสดงอรรถประโยชน์ใน LC-MS/MS และ metabolomics ในเอกสารสองฉบับต่อไปนี้:
1) PMID: 19602524 "การทำให้เป็นมาตรฐานของความเข้มสูงสุดในโปรตีโอมิกส์จากล่างขึ้นบนโดยใช้การสลายตัวของค่าเอกพจน์"
Karpievitch YV, Taverner T, Adkins JN, Callister SJ, Anderson GA, Smith RD, Dabney AR
ชีวสารสนเทศ 2009
2) "การทำให้เป็นมาตรฐานของข้อมูลเมตาโบโลมิกส์ด้วย EigenMS"
Karpievitch YV, Nikolic SB, Wilson R, Sharman JE, Edwards LM
พลีส วัน 2014
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
MATLAB, เอส/อาร์
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/eigenms/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา