นี่คือแอป Linux ชื่อ kSNP เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น kSNP3.1_Linux_package.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า kSNP เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
kSNP เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์
Ad
DESCRIPTION
kSNP ระบุ SNP ของแพน-จีโนมในชุดของลำดับจีโนม และประเมินต้นไม้สายวิวัฒนาการตาม SNP เหล่านั้น การค้นพบ SNP ขึ้นอยู่กับการวิเคราะห์ k-mer และไม่ต้องการการจัดตำแหน่งหลายลำดับหรือการเลือกจีโนมอ้างอิง ดังนั้น kSNP สามารถใช้จีโนมของจุลินทรีย์ 100 ตัวเป็นอินพุตได้ โลคัส SNP ถูกกำหนดโดยโอลิโกที่มีความยาว k รอบอัลลีล SNP ตรงกลาง kSNP สามารถวิเคราะห์ทั้งจีโนมที่สมบูรณ์ (สำเร็จรูป) และจีโนมที่ยังไม่เสร็จในส่วนที่ประกอบกันหรือการอ่านแบบดิบที่ไม่ได้ประกอบ จีโนมที่เสร็จแล้วและจีโนมที่ยังไม่เสร็จสามารถวิเคราะห์ร่วมกันได้ และ kSNP สามารถดาวน์โหลดไฟล์ Genbank ของจีโนมที่เสร็จแล้วได้โดยอัตโนมัติ และรวมข้อมูลในไฟล์เหล่านั้นไว้ในหมายเหตุประกอบ SNPGardner, SN and Hall, BG 2013 เมื่อการจัดตำแหน่งจีโนมทั้งหมดใช้ไม่ได้ผล: ซอฟต์แวร์ kSNP v2 สำหรับการค้นพบ SNP ที่ปราศจากการจัดตำแหน่งและสายวิวัฒนาการของจีโนมจุลินทรีย์หลายร้อยชนิด กรุณาหนึ่ง 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/ksnp/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
