นี่คือแอป Linux ชื่อ Molecular Dynamics Studio ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น WindowsRelease.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า Molecular Dynamics Studio พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ:
สตูดิโอโมเลกุลไดนามิกส์
รายละเอียด:
นี่คือชุดของการปรับเปลี่ยนซอฟต์แวร์ที่สร้างขึ้นเพื่อผสานรวม NanoEngineer-1, PACKMOL และ MSI2LMP เพื่อสร้างเซลล์ไดนามิกโมเลกุลอย่างง่ายดาย NanoEngineer-1 เป็นซอฟต์แวร์ CAD ระดับโมเลกุลที่เขียนขึ้นโดย Nanorex และให้วิธีง่ายๆ แก่ผู้ใช้ในการสร้างโมเลกุล ในขณะที่การปรับเปลี่ยนซอฟต์แวร์ทำให้ผู้ใช้สามารถพิมพ์อะตอมโดยใช้สนามแรงหลายสนาม PACKMOL สามารถสร้างกลุ่มโมเลกุลแบบสุ่มโดยใช้เทมเพลตโมเลกุลจาก NanoEngineer-1 ดังนั้นจึงเป็นการสร้างเซลล์ MD เริ่มต้น การปรับเปลี่ยน PACKMOL อนุญาตให้ส่งข้อมูลประเภทอะตอมไปยังซอฟต์แวร์ MSI2LMP MSI2LMP สร้างไฟล์อินพุต LAMMPS ตามฟิลด์บังคับคลาส I หรือคลาส II MSI2LMP ได้รับการแก้ไขเพื่อใช้ข้อมูลสนามบังคับที่เป็นตัวเลขที่สร้างโดย NanoEngineer-1 รูปแบบไฟล์ MMP ได้รับการขยายและรวมเข้ากับแอพพลิเคชั่นซอฟต์แวร์ทั้งสาม
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
คุณสมบัติ
- ความสามารถ CAD ระดับโมเลกุลผ่าน NanoEngineer-1
- พิมพ์อะตอมด้วยตนเองตามสนามแรงปรมาณู CFF91
- สร้างเทมเพลตโมเลกุลโดยใช้ NanoEngineer-1
- สร้างเซลล์ MD โดยใช้ PACKMOL และเทมเพลตหลายโมเลกุล
- สร้างไฟล์อินพุตเรขาคณิต LAMMPS โดยใช้ MSI2LMP
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
OpenGL, Qt
ภาษาโปรแกรม
ฟอร์แทรน, ไพธอน, C++, C
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา