bowtie2-inspect-s - Online sa Cloud

Ito ang command na bowtie2-inspect-s na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

PROGRAMA:

NAME


bowtie2-inspect-s - kumukuha ng impormasyon mula sa isang bowtie2 index

SINOPSIS


bowtie2-inspeksyon [pagpipilian]*

DESCRIPTION


Bowtie 2 bersyon 2.2.6 ni Ben Langmead (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)


bt2 filename minus trailing .1.bt2/.2.bt2

Bilang default, nagpi-print ng mga tala ng FASTA ng mga naka-index na pagkakasunud-sunod ng nucleotide sa pamantayan
palabas. Sa -n, nagpi-print lang ng mga pangalan. Sa -s, nagpi-print lang ng buod ng index
mga parameter at pagkakasunud-sunod. Sa -e, pinapanatili ang mga kulay kung naaangkop.

Opsyon


-a/--sa kabila
Bilang ng mga character sa output ng FASTA (default: 60)

-n/--mga pangalan
I-print lamang ang mga pangalan ng sequence ng reference

-s/--buod
I-print ang buod kasama. mga pangalan ng ref, haba, katangian ng index

-e/--bt2-ref
Buuin muli ang reference mula sa .bt2 (mabagal, pinapanatili ang mga kulay)

-v//--verbose
Verbose na output (para sa pag-debug)

-h/--tulong
i-print ang detalyadong paglalarawan ng tool at mga pagpipilian nito

- Tumulong i-print ang mensahe ng paggamit na ito

Gumamit ng bowtie2-inspect-s online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net



Pinakabagong Linux at Windows online na mga programa