Ito ang command na cm_to_wigeon na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
cm_to_wigeon - katulong para sa wigeon (Pintail 16S DNA anomaly detection)
DESCRIPTION
Sa kasamaang-palad ito mga kasangkapan na dumating in koneksyon sa wigeon(1) is hindi dokumentado pero it
tungkol ang pagpipilian sa ibaba. If ikaw kilala mas mabuti tungkol sa nito layunin pakiusap ilaglag us a nota
paggamit reportbug on iyong Debian system.
Opsyon
Kailangan:
--query_NAST
multi-fasta file na naglalaman ng mga query sequence sa alignment na format
--db_NAST
db sa NAST na format
--db_FASTA
db sa fasta format (megablast formatted)
Karaniwan pagpipilian
-n bilang ng nangungunang tumutugmang mga sequence ng database na ihahambing sa (default 15)
-R min divergence ratio default: 1.007
-P min na porsyentong pagkakakilanlan sa mga tumutugmang sequence (default 90)
parameter sa magtono ChimeraMaligner:
Mga parameter ng pagmamarka:
-M marka ng pagtutugma (default: +5)
-N hindi tugmang parusa (default: -4)
-Q min na saklaw ng query sa pamamagitan ng pagtutugma ng sequence ng database (default: 70)
-T maximum na pagtawid ng maramihang alignment (default: 1)
Mga Bandila:
--printAlignments
(naka-off ang default)
-v pandiwang
--exec_dir
cd dito bago tumakbo
Gamitin ang cm_to_wigeon online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net