cmtk-epiunwarp - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

epiunwarp - Unwarp Echo Planar Images

SINOPSIS

epiunwarp InputImage1 InputImage2 OutputImage1 OutputImage2 OutputDFField OutputDFieldRev

DESCRIPTION

Tamang B0 field inhomogeneity-induced distortion sa Echo Planar Images (hal., diffusion-
may timbang na mga larawan) gamit ang dalawang larawang nakuha na may magkasalungat na bahagi ng mga direksyon sa pag-encode.

Opsyon

Global Toolkit Options (ito ay Nagbahagi by lahat CMTK kasangkapan)
- Tumulong
Sumulat ng listahan ng mga pangunahing opsyon sa command line sa karaniwang output.

--tulong-lahat
Sumulat ng kumpletong listahan ng basic at advanced na mga opsyon sa command line sa karaniwang output.

--wiki
Isulat ang listahan ng mga opsyon sa command line sa karaniwang output sa MediaWiki markup.

--lalaki
Isulat ang man page source sa 'nroff' markup sa karaniwang output.

--bersyon
Isulat ang bersyon ng toolkit sa karaniwang output.

--echo
Isulat ang kasalukuyang command line sa karaniwang output.

--verbose-level
Itakda ang antas ng verbosity.

--verbose, -v
Dagdagan ang antas ng verbosity ng 1 (hindi na ginagamit; suportado para sa backward compatibility).

--mga thread
Itakda ang maximum na bilang ng mga parallel na thread (para sa POSIX thread at OpenMP).

input Imahen parameter
--phase-encode
Tukuyin ang phase-encoded na direksyon ng coordinate ng imahe. Mga sinusuportahang halaga: "phase-
encode-ap", "phase-encode-is", "phase-encode-lr", kung saan ang default ay "phase-encode-
ap", o gumamit ng isa sa mga sumusunod:

--phase-encode-ap, -y
Anterior/posterior phase encoding (ito ang pinakakaraniwang kaso) [Ito is ang
default]

--phase-encode-is, -z
Top/bottom phase encoding (ito ay bihira)

--phase-encode-lr, -x
Lateral, kaliwa/kanang phase encoding (ito ay napakabihirang)

--walang-pitik
Gamitin ang switch na ito ay ang reverse phase-encoded na imahe ay hindi kailangang i-flip bago
sa unwarping. Kung ang normal at reverse phase-encoded na imahe ay ipinapakita sa parehong gross
orientation sa 'triplanar', pagkatapos ay hindi kailangan ang pag-flip at dapat na i-off
gamit ang switch na ito.

Optimization parameter
--no-init-shift-com
Huwag paganahin ang pagsisimula ng unwarping sa pamamagitan ng paglilipat sa bawat hilera upang ihanay ang mga sentro ng masa
ng forward at reverse acquisition. Sa halip, gumamit ng all-zero initial deformation field.

--smooth-sigma-max
Maximum na image smoothing kernel width para sa coarsest level ng multi-scale computation.
[Default: 8]

--smooth-sigma-min
Minimum na image smoothing kernel width para sa pinakamagandang antas ng multi-scale computation (0 =
walang pagpapakinis; orihinal na sukat ng imahe). [Default: 0]

--smooth-sigma-diff
Pagkakaiba sa pagitan ng image smoothing kernel widths sa pagitan ng dalawang magkasunod na antas ng
multi-scale computation. [Default: 0.25]

--kinis-pagpigil-timbang
Weight factor para sa second-order smoothness constraint term sa unwarping cost
function. [Default: 0]

--folding-constraint-weight
Salik ng timbang para sa termino ng pagpipigil sa pagpipigil sa pagtitiklop sa hindi pagkukulang na gastos
function. [Default: 0]

--mga pag-ulit , -i
Bilang ng L-BFGS optimization iteration (bawat multi-scale level). [Default: 10]

Pagbubuhos Options
--write-jacobian-fwd
Sumulat ng Jacobian intensity correction map para sa forward na imahe. [Default: WALA]

--isulat-jacobian-rev
Sumulat ng Jacobian intensity correction map para sa reverse-encoded na imahe. [Default: WALA]

MGA AUTHORS

Torsten Rohlfing, na may mga kontribusyon mula kay Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, at Yaroslav Halchenko

Gamitin ang cmtk-epiunwarp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net