Ito ang command geneparse-mpi na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
geneparse - sequence file loader frontend
SINAPSE
geneparse [mga opsyon...] [input] [input2 ...] #read input at sumulat sa stdout
DESCRIPTION
Nagbabasa ng sequence file at isinusulat ito sa isang lugar (bilang default sa stdout).
Ang isang partikular na hanay sa loob ng isang input file ay maaaring tukuyin ng file[start,stop]. Ang parisukat
maaaring palitan ang mga bracket para sa alinman sa {[()]}, (hal. "genome.fa[3000,4000]" o
"genome.fa{3000~4000}"). Magkaroon ng kamalayan na ang lahat ng iyon ay maaaring ma-parse ng iyong shell. Gayundin
anumang character na hindi salita ay maaaring gamitin upang paghiwalayin ang mga numero.
Opsyon
--repeatmask|-r
gumamit ng mga soft-repeatmasked na sequence (ibig sabihin: palitan ang mga lowercase na base ng N's).
--itaas|--unmask|-U
uppercase lahat ng base.
--haba|-l
i-print lamang ang haba at lumabas
--malinis|-c
huwag magdagdag ng bagong linya kapag natapos na
--bersyon|-V
nagpi-print ng bersyon ng programa
--tulong|-h
nagpi-print ng mensahe ng tulong
--output|-o
magpadala ng output sa isang file (kung hindi man ay gumamit ng stdout). --output ay nagpapahiwatig --malinis.
--tahimik|-q
patahimikin ang lahat ng babala
--verbose|-v
nagpi-print ng maraming karagdagang detalye
Gumamit ng geneparse-mpi online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net