Ito ang Linux app na pinangalanang Calis-p na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang calis-p-0.1.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Calis-p para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Calis-p na tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang Calis-p (Ang diskarte ng CALgary sa ISotopes sa proteomics) ay isang software package upang direktang kunin ang mga stable na carbon isotope fingerprint (SIF) ng mga indibidwal na species sa isang microbial na komunidad mula sa isang metaproteomic na dataset. Kinakailangan ang mga nakapuntos na peptide-spectrum match (PSM) na mga talahanayan para sa mga sample at materyal sa pagkakalibrate, at ang raw MS data sa mzML na format bilang input. Sa unang hakbang, hinahanap ng software ang mga isotopic na peak para sa bawat PSM at isasama ang kanilang intensity sa isang tinukoy na window ng oras ng pagpapanatili. Ang mga natukoy na isotopic pattern (mga pares ng m/z value + summed intensities) kasama ang sum formula ng mga natukoy na peptides ay iniuulat at ginagamit bilang input para sa ikalawang hakbang ng Calis-p upang makalkula ang mga halaga ng delta13C para sa lahat ng peptides na pumasa sa isang set ng mga filter, pati na rin ang mga average na halaga ng delta13C at mga karaniwang error para sa bawat species. Ang mga halaga ng species delta13C ay kailangang itama para sa isotope fractionation ng instrumento sa pamamagitan ng paglalapat ng offset na tinutukoy gamit ang reference na materyal.Mga tampok
- Direktang kinukuha ang data ng SIF mula sa isang karaniwang metaproteomic na dataset
- Mahusay at mapagkakatiwalaang makakuha ng mga halaga ng SIF para sa isang malaking bilang ng mga species sa isang sample ng microbial na komunidad sa isang high-throughput na paraan.
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
