Ito ang Linux app na pinangalanang Protein Contact Matrix Generator na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang PCMGen1.0_executable.jar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Protein Contact Matrix Generator na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Protein Contact Matrix Generator
DESCRIPTION
Ang isang protein contact matrix ay 2D na representasyon ng mga distansya sa pagitan ng mga residue ng amino acid sa isang 3D na istraktura ng protina. Ang Protein Contact Map Generator (PCMGen) ay isang command line tool na kumukuha ng mga istrukturang 3D ng protina (PDB format file) bilang input at kino-compute ang mga distansya ng contact sa pagitan ng dalawang chain (mula sa isa o dalawang magkaibang protina). Ang mga matrix file na ito ay maaaring higit na mailarawan bilang Contact Maps gamit ang iba pang visualization tool/programs (tulad ng R-heatmaps).
Maaaring gamitin ang Contact Maps upang maunawaan ang mga protina' :
1. Pangalawang istruktura
2. Conformational arrangement
3. Mga pakikipag-ugnayan sa ibabaw
Mga tampok
- Structural Informatics
- Mapa ng Protein Contact
- Java based na CLI application
Audience
Mga End User/Desktop
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Java
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/proteincontactmap/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
