Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen delta2maf komutudur.
Program:
ADI
delta2blocks - hizalamaları sıralamak için mugsy yamasından mummer için ekstra araç
delta2maf - hizalamaları sıralamak için mugsy yamasından mummer için ekstra araç
SİNOPSİS
delta2 blokları [seçenekler]<refkimlik><Qrykimlik>
delta2maf [seçenekler]<refkimlik><Qrykimlik>
TANIM
-h Yardım bilgilerini göster
-q Hizalamaları sorgu başlangıç koordinatına göre sıralayın
-r Hizalamaları referans başlangıç koordinatına göre sıralayın
-w int Ekran genişliğini ayarlayın - varsayılan 60'tır
-x int Matris türünü ayarlayın - varsayılan 2'dir (BLOSUM 62), diğer seçenekler arasında 1 (BLOSUM 45) bulunur
ve 3 (BLOSUM 80)
not: sadece amino asit hizalamaları üzerinde etkisi vardır
Girdi, üzerinde geçirilen "nucmer" veya "promer" programının .delta çıktısıdır.
Komut satırı.
Çıktı stdout içindir ve sorgu ile referans arasındaki tüm hizalamalardan oluşur.
komut satırında tanımlanan diziler.
NOT: Varsayılan olarak sıralama yapılmaz, bu nedenle hizalamalar,
NS giriş.
onworks.net hizmetlerini kullanarak delta2maf'ı çevrimiçi kullanın