palogist - Bulutta Çevrimiçi

Program:

ADI

palogist - Bir lojistik model kullanarak Genom Çapında İlişkilendirme Analizi gerçekleştirin

SİNOPSİS

palolog [ komut satırı seçenekleri ]

AÇIKLAMA

palolog büyük empoze edilmiş veri kümeleri üzerinde verimli bir şekilde doğrusal bir regresyon çalıştırır.

Opsiyonlar

gereklidir komuta hat seçenekleri
-P, --feno DOSYA
fenotip verilerini oku DOSYA

-ben, --bilgi DOSYA
SNP bilgilerini şu adresten okuyun: DOSYA (örn. MLINFO dosyası).

-NS, --doz DOSYA
SNP tahmincisi (örn. MLDOSE/MLPROB) dosya adı.

İsteğe bağlı komuta hat seçenekleri
-M, --harita DOSYA
Her SNP için baz çifti konumlarını içeren eşleme dosyası adı.

-N, --nidler NUMBER
Analiz edilecek kişi sayısı.

-C, --krom DOSYA
Kromozom (çıktıya aktarılacak).

-Ö, --dışarı DOSYA
Çıktı dosyası adı (varsayılan regresyon.out.txt ).

-Evet, --atla NUMBER
Tahmin (doz/prob) dosyasında atlanacak sütun sayısı (varsayılan 2'dir).

-T, --nitelikler NUMBER
Kaç özellik analiz edilir (varsayılan 1'dir).

-G, --ngpredler NUMBER
İşaretçi başına kaç tahmin sütunu (varsayılan 1 = MLDOSE; yoksa MLPROB için 2 kullanın).

-A, --ayrı DOSYA
Alanları ayırmak için karakter (varsayılan boşluktur).

-R, --Puan
Puan testini kullanın.

, -e --kafasız
Çıktıda başlık satırını bildirmeyin.

-l --allcov
Tüm ortak değişkenler için tahminleri bildirin (büyük çıktılar!).

-B, --etkileşim
SNP analizi ile etkileşim için kullanılacak ortak değişken (varsayılan
etkileşim, 0).

-k, --etkileşim_yalnızca
Facebok sayfasını beğenin : --etkileşim ancak SNP ile etkileşim içinde hareket eden ortak değişken olmadan (varsayılan
etkileşim yok, 0).

-içinde, --mmscore DOSYA
İlgili bireylerin örneklemlerinde puan testi. DOSYA bağımsız değişkeni, bir
ters korelasyon matrisi ile dosya. BU ÖZELLİĞİN HALA OLDUĞUNU DİKKATE ALIN
DENEYSEL!

--güçlü
Sağlam (diğer adıyla sandviç, diğer adıyla Hubert-White) standart hataları bildirin.

--yardım et Yardım yazdırın.

onworks.net hizmetlerini kullanarak paologisti çevrimiçi kullanın