Bu, en son sürümü bambam-1.4.tgz olarak indirilebilen BamBam adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
BamBam adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
BamBam
AÇIKLAMA:
BamBam, yeni nesil DNA dizileme verilerini analiz etmek için çok sayıda araç içerir. SNP'leri ve indelleri çağırmak, büyük ölçekli silmeleri belirlemek, eşlenmiş okuma sayılarını tablolamak, metilasyon analizi ve daha fazlası için araçlar sağlanmıştır.
SAMtools'a bağlıdır (http://samtools.sourceforge.net/) ve BAMtools (https://github.com/pezmaster31/bamtools). Ayrıca indirme tarball'ında bulunan BioPerl'i kullanır.
Özellikler
- SNP'leri ve indelleri çağırın
- impute genotipler
- konsensüs dizileri oluşturmak
- eşlenen okumaların sayılarını tablo haline getir (RNA-seq)
- K-araç kümeleme ile haplotip fazlamasını çıkarsama
- DNA metilasyonunu analiz eder (bisülfit dizilimi)
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Perl, C++
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/bambam/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.