Bu, en son sürümü mipgen_v15.tar.gz olarak indirilebilen MIPGen adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
MIPGen adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN GÖRÜNTÜLERİ:
MIPGen
AÇIKLAMA:
Moleküler Etkileşim Potansiyeli Üreteci
MIPGEN, Moleküler Etkileşim Potansiyeli ızgaralarını hesaplayacak bir python programıdır.
belirli bir molekül üzerinde, bu bir protein veya küçük bir organik bileşik (ilaç) olabilir.
Çıktı, kullanıcının yapabileceği DX formatlı (*.dx) bir dizi ızgara olacaktır.
VMD, PyMol, Chimera gibi herhangi bir Moleküler görselleştirme programını kullanarak görselleştirmek için...
Bağımlılıklar ve kullanım hakkında daha fazla bilgi için lütfen Belgeleri okuyun.
Kullanıcılar, HATALAR ve İSTEKLER menüsü altında herhangi bir hata veya istek gönderebilirler. (sourceforge hesabına ihtiyaç duyulacaktır).
Özellikler
- Basit bir PDB dosyası verilen tam otomatik MIP üretimi.
- Açık kaynak kodu. Kullanıcılar, araştırmaların genişletilmesine veya kodun iyileştirilmesine katkıda bulunabilirler.
- Peptitler ve diğer makromoleküler sistemler üzerinde ızgara tabanlı moleküler etkileşim potansiyellerini hesaplayın (muhtemelen büyük sistemler için hala yavaştır)
- Küçük moleküller üzerinden MIP'yi hesaplayın
- Özelleştirilebilir problar. Halihazırda uygulanmış: Hidrofobik, H-Bond donör, H-Bond alıcı ve elektrostatik problar.
- AmbertTools paketinden açık kaynaklı Antechamber ve tLeap ile arayüz oluşturarak atom türlerinin küçük moleküllere ve proteinlere otomatik olarak atanması (http://ambermd.org)
Seyirci
Bilim/Araştırma, Gelişmiş Son Kullanıcılar, Geliştiriciler, Son Kullanıcılar/Masaüstü
Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal
Programlama dili
Python
Veritabanı Ortamı
SQLite
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/mipgen/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.