Bu, en son sürümü Version5.3.1sourcecode.tar.gz olarak indirilebilen Seurat adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
Seurat adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN GÖRÜNTÜLERİ:
Seurat
AÇIKLAMA:
Seurat, NYGC'deki Satija Laboratuvarı tarafından sunulan, tek hücreli genomik analiz için kapsamlı bir R araç setidir. Kalite kontrolü, normalizasyon, kümeleme, çok modlu verilerin entegrasyonu (örneğin, scRNA-seq, uzamsal, CITE-seq) ve görselleştirmeyi destekler. Seurat v5, tek hücre çalışmaları için akademik ve endüstriyel araştırmalarda yaygın olarak kullanılan ölçeklenebilir iş akışları ve uzamsal transkriptomik desteği sunar.
Özellikler
- scRNA-seq için kalite kontrol ve normalizasyon hatları
- Boyut küçültme, kümeleme ve hücre tipi açıklaması
- Örnekler ve yöntemler arasında entegrasyon
- Mekansal transkriptomik analiz ve görselleştirme
- Büyük ölçekli veri kümelerini verimli bir şekilde işler (v5 ölçeklenebilirliği)
- Kapsamlı kısa öyküler, eğitimler ve Bioconductor ile entegrasyon
Programlama dili
R
Kategoriler
Bu uygulama, https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/ adresinden de indirilebilir. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden çevrimiçi olarak en kolay şekilde çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.