Це команда minctoecat, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
minctecat - конвертувати файл формату minc у файл формату Ecat7
СИНТАКСИС
м'яка кішка [ ]
м'яка кішка [-довідка]
ОПИС
м'яка кішка перетворить 2D-зображення, 3D-об'єми або 4D-динамічні томи, написані на Minc
формат файлу у 2D, 3D або 4D файл Ecat7. Тоді як формат Ecat7 був розроблений для
Обсяг ПЕТ, випущений сканерами Ecat (CTI/SIEMENS - Ноксвілл, Теннесія, США) він зчитує будь-який minc
тип об’єму (статичний ПЕТ, динамічний ПЕТ, аМРТ, фМРТ, етикетки), що надається будь-яким
бренд томографа та перетворити його на життєздатний файл Ecat7 з точки зору кількості розмірів,
розмір розміру, крок розміру, орієнтація, просторове положення, значення вокселів і вокселів
одиниця. Крім того, він намагається якнайкраще заповнити додаткові поля заголовка Ecat7
доступні змінні та атрибути minc. За замовчуванням він витягує ці додаткові
інформація із загальних змінних minc, а саме: пацієнт_змінна, дослідження_змінна,
acquisition_variable. У випадку об’ємів, які спочатку поставляються ПЕТ-сканерами Ecat,
тоді інші змінні зазвичай доступні в заголовку minc:
ecat_acquisition_variable, ecat_main і ecat_sub-header_variable. Там, за такий мін
обсяг, перетворення дає том Ecat7, майже ідентичний оригінальному нативному
обсяг в термінах полів заголовка. Користувач може змінити цю поведінку за допомогою списку ігнорування
параметри (див. розділ параметрів).
ВАРІАНТИ
Зауважте, що параметри можна вказувати в скороченому вигляді (якщо вони унікальні) і
можна вказати в будь-якому місці командного рядка.
Command конкретний опції
-ignore_patient_variable: Ігнорувати інформацію зі змінної пацієнта minc (MIpatient).
-ignore_study_variable: Ігноруйте інформацію зі змінної дослідження minc (MIstudy).
-ignore_acquisition_variable: Ігноруйте інформацію зі змінної отримання minc
(придбання MI).
-ignore_ecat_accquisition_variable: Ігноруйте інформацію, отриману від minc ecat
змінна (MIecat_acquisition).
-ignore_ecat_main_variable: Ігноруйте інформацію зі змінної minc ecat-mainheader
(MIecat-головний).
-ignore_ecat_subheader_variable: Ігноруйте інформацію зі змінної minc ecat-subheader
(MIecat-підзаголовок).
-no_decay_corr_fctr: не відновлювати коефіцієнти корекції розпаду, що використовуються як частина як
реконструкція оригінального об'єму ПЕТ. Поправочними коефіцієнтами є поле в
підзаголовки ecat, які можуть використовуватися програмами обробки. За замовчуванням, якщо обсяг дорівнює a
Обсяг ПЕТ, ці фактори відновлюються. Цей варіант не має інтересу в разі відсутності
Дані ПЕТ.
- етикетка: Розглядає воксель як цілі значення замість значень з плаваючою комою. У цьому випадку,
масштабні коефіцієнти та коефіцієнти калібрування встановлені в одиницю. Цей варіант є
особливо корисно, коли вхідні файли minc є обсягом міток.
Загальне опції
-допомога: Роздрукувати підсумок параметрів командного рядка та перервати
-версія: Роздрукувати версію програми та перервати
KNOWN БУГИ
Поки що жодної помилки не вказано:=)
Використовуйте minctoecat онлайн за допомогою служб onworks.net