Це команда stretchere, яку можна запустити у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
підрамник - Needleman-Wunsch швидке глобальне вирівнювання двох послідовностей
СИНТАКСИС
носилки -послідовність послідовність - послідовність послідовність [-файл даних матриця] [-гапопен ціле]
[- gapeextend ціле] - вихідний файл вирівнювати
носилки -допомога
ОПИС
носилки — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Він є частиною командної групи (груп) «Вирівнювання: Глобальне».
ВАРІАНТИ
вхід розділ
-послідовність послідовність
- послідовність послідовність
-файл даних матриця
Це файл матриці оцінки, який використовується під час порівняння послідовностей. За замовчуванням це
файл «EBLOSUM62» (для білків) або файл «EDNAFULL» (для нуклеїнових послідовностей). Ці
файли знаходяться в каталозі 'data' інсталяції EMBOSS.
Додатковий розділ
-гапопен ціле
Значення за замовчуванням: @($(acdprotein)? 12 : 16)
- gapeextend ціле
Значення за замовчуванням: @($(acdprotein)? 2 : 4)
Вихід розділ
- вихідний файл вирівнювати
Використовуйте stretchere онлайн за допомогою сервісів onworks.net