Це програма для Linux під назвою EvidentialGene, останню версію якої можна завантажити як evigene23jul15.tar. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою EvidentialGene з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
СКРЕНИ:
EvidentialGene
ОПИС:
EvidentialGene — це проект із інформатики геному «Конструкція генів для еукаріотів, орієнтована на докази», для створення високоякісних, точних наборів генів для тварин і рослин, розроблений Доном Гілбертом з Університету Індіани, див.
http://arthropods.eugenes.org/EvidentialGene/
Конструкція відноситься до комбінації класичного прогнозування генів і новітніх методів складання генів (de-novo і за допомогою генома). Основні методи Evigene включають використання доступного найкращого програмного забезпечення для прогнозування та складання генів, що поєднує всі докази генів, від експресованих послідовностей, послідовностей складання геному, послідовностей споріднених видів білків та будь-яких інших, щоб анотувати та оцінювати генні конструкції. Надмірно вироблені конструкції класифікуються на основі генних доказів найкращих якостей для кожного «локусу», включаючи ідентифікацію локусу, вирівняного з геномом та вирівняного з транскриптом гена (без геному). Усе програмне забезпечення, розроблене для EvidentialGene, є загальнодоступним. Нотатки дивіться у вікі/блозі проекту.
риси
- Описано вище
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Perl
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/evidentialgene/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.