Це програма для Linux під назвою SASHIMI, останню версію якої можна завантажити як TPP_Setup_6.3.3.exe. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою SASHIMI з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
СКРЕНИ:
САШІМІ
ОПИС:
У проекті Sashimi розміщено Trans-Proteomic Pipeline (TPP), зрілий набір інструментів для протеоміки на основі масових специфікацій (MS, MS/MS): статистична перевірка, кількісне визначення, візуалізація та перетворювачі з необроблених даних MS у відкритий mzML/ формати mzXML.
риси
- Пошукові системи баз даних (comet тощо)
- SpecraST (пошукова система бібліотеки спектру)
- Відкритий масовий пошук (Magnum тощо)
- Kojak (пошук зшивання)
- Аналіз DDA
- DISCo (аналіз DIA)
- reSpect (химерний спектральний аналіз)
- MS1 і MS2 кількісне визначення з мітками та без міток
- Створення бази даних Decoy
- PeptideProphet (Перевірка рівня PSM)
- iProphet (перевірка рівня пептидів)
- PTMProphet (перевірка модифікації після трансляції)
- Перевірка рівня білка
- Генерація бібліотеки Spectrum
- Інструменти візуалізації даних
- Каталогізація та прогнозування часу зберігання
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Веб-орієнтований, командний рядок
Мова програмування
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/sashimi/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.