Це програма для Linux під назвою SOAPdenovo2, останню версію якої можна завантажити як SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою SOAPdenovo2 з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
SOAPденово2
ОПИС:
Що буде далі з SOAPdenovo2:
MEGAHIT є формальним наступником SOAPdenovo2
MEGAHIT: Надшвидке одновузлове рішення для великої та складної метагеномічної збірки за допомогою короткого графіка де Брюйна
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Останній код на GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo — це новий метод складання короткого читання, який може створити проект збірки de novo для геномів людського розміру. Програма спеціально розроблена для складання коротких читань Illumina. Це створює нові можливості для створення еталонних послідовностей і проведення точного аналізу недосліджених геномів економічно ефективним способом. SOAPdenovo2 є наступником SOAPdenovo. Процитуйте статтю, опубліковану в GigaScience (див. веб-сайт нижче), якщо ви хочете процитувати SOAPdenovo2.
Аудиторія
Наука/Дослідження, Розробники
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
C++, C
Середовище бази даних
Плоский файл
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.